MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 12342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	T	6	6	3	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017190	T	6	6	14	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017190	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017190	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017190	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017190	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017190	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017190	GT	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017190	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017190	AAAAG	2	10	385	394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017190	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017190	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017190	T	6	6	1894	1899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017190	AT	3	6	1903	1908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017190	ATTAT	2	10	1911	1920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017190	AGG	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017190	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017190	TCA	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017190	CAAG	2	8	3135	3142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017190	T	6	6	3166	3171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017190	AT	3	6	4837	4842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017190	T	6	6	6828	6833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017190	GCT	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017190	CTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017190	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017190	T	7	7	7002	7008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017190	TA	3	6	9506	9511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017190	A	6	6	9519	9524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017190	GAT	2	6	9540	9545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017190	TGT	2	6	9563	9568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017190	T	6	6	9602	9607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017190	GAG	2	6	9662	9667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017190	CAA	2	6	9668	9673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017190	TAAA	2	8	9724	9731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017190	AGTC	2	8	9750	9757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017190	ACT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017190	GGC	2	6	9803	9808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017190	CT	3	6	9850	9855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017190	GCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017190	CCTG	2	8	9893	9900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017190	CGA	2	6	10048	10053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017190	GCA	2	6	10122	10127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017190	CGC	2	6	10169	10174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017190	GTGA	2	8	10175	10182	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017190	TGT	2	6	10208	10213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017190	GAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017190	GGC	2	6	10242	10247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017190	CAG	2	6	10291	10296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017190	ATT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017190	AGA	2	6	10432	10437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017190	GGA	2	6	10482	10487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017190	CT	3	6	10507	10512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017190	GAG	2	6	10530	10535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017190	TGC	2	6	10627	10632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017190	GAA	2	6	10746	10751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017190	GGT	2	6	10820	10825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017190	GTC	2	6	10834	10839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017190	TCGTG	2	10	10843	10852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017190	GGA	2	6	10946	10951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017190	ATC	2	6	10970	10975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017190	AC	3	6	10997	11002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017190	AC	3	6	11166	11171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017190	CAC	2	6	11181	11186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017190	AGCC	2	8	11229	11236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017190	GAT	2	6	11252	11257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017190	CCT	2	6	11308	11313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017190	GGT	2	6	11465	11470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017190	CCA	2	6	11487	11492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017190	AGG	2	6	11547	11552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017190	CCA	2	6	11577	11582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017190	GGACG	2	10	11717	11726	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017190	AAGC	2	8	11753	11760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017190	CAC	2	6	11792	11797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017190	GGA	2	6	11877	11882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017190	GCG	2	6	11911	11916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017190	AGG	2	6	12029	12034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017190	TC	3	6	12061	12066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017190	CGG	2	6	12085	12090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017190	GGA	2	6	12117	12122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017190	AGT	2	6	12238	12243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017190	AGA	2	6	12319	12324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017190	CACG	2	8	12449	12456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017190	TC	3	6	12522	12527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017190	AGC	2	6	12780	12785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017190	TTC	2	6	12878	12883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017190	ACC	2	6	13106	13111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017190	G	6	6	13131	13136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017190	AGG	2	6	13141	13146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017190	GCGA	2	8	13237	13244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017190	TAG	2	6	13249	13254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017190	GAG	2	6	13336	13341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017190	GA	3	6	13359	13364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017190	GA	3	6	13438	13443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017190	CGG	2	6	13596	13601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017190	GA	3	6	13694	13699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017190	TAGG	2	8	13812	13819	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017190	TAC	2	6	13866	13871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017190	CGC	2	6	13896	13901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017190	CGGG	2	8	13908	13915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017190	CCT	2	6	13954	13959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017190	GGT	2	6	14090	14095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017190	CGT	2	6	14285	14290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017190	GAG	2	6	14334	14339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017190	GTT	2	6	14388	14393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017190	C	6	6	14461	14466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_017190	GAT	2	6	14512	14517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017190	ATCG	2	8	14573	14580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017190	GA	3	6	14626	14631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017190	TGG	2	6	14647	14652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017190	CGC	2	6	14750	14755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017190	TCA	2	6	14782	14787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017190	T	6	6	14797	14802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017190	ATA	2	6	15845	15850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017190	A	6	6	17356	17361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017190	T	8	8	17390	17397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017190	TGT	2	6	17423	17428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017190	TTTGAA	2	12	17431	17442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017190	ATGA	2	8	17475	17482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017190	AAGA	2	8	18834	18841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017190	TGA	2	6	18846	18851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017190	A	6	6	18881	18886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017190	A	7	7	18900	18906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017190	ATCT	2	8	18911	18918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017190	AG	3	6	20617	20622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017190	GTG	2	6	20630	20635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017190	T	6	6	20803	20808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017190	GTT	2	6	20832	20837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017190	AAGAA	2	10	23417	23426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017190	A	7	7	23429	23435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017190	TAT	2	6	23475	23480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017190	GGA	2	6	23494	23499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017190	TCC	2	6	23577	23582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017190	AT	3	6	23617	23622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017190	T	6	6	23660	23665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017190	A	6	6	23672	23677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017190	TAT	2	6	23707	23712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017190	TCC	2	6	24995	25000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017190	A	7	7	25067	25073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017190	TGAA	2	8	26376	26383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017190	CCT	2	6	26389	26394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017190	A	6	6	26419	26424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017190	CTG	2	6	27008	27013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017190	A	6	6	27046	27051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017190	AAG	2	6	27055	27060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017190	AG	3	6	27059	27064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017190	TG	3	6	27593	27598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017190	CAT	2	6	27599	27604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017190	ATTT	2	8	27631	27638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017190	GCCT	2	8	27729	27736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017190	TAAG	2	8	27737	27744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017190	GGAA	2	8	27799	27806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017190	GCA	2	6	27807	27812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_017190	ATT	2	6	31264	31269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017190	TTG	2	6	53823	53828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_017190	AAC	2	6	111747	111752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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